新型コロナウイルスと共存した後も、ウイルスを監視する必要があるのでしょうか？

COVID-19との共存は、それを無視するのではなく、理解することに基づいている必要があります。

周イェビン著

12月25日、国家衛生健康委員会は「今後、毎日の流行情報は公表されない」との声明を発表した。大規模な核酸検査が撤退したため、核酸検査に頼る公的機関が発表する感染者数は、もはや感染実態を反映していない。抗原自己検査で診断される人が増えており、症状があっても検査するための抗原検査キットを持っていない人も多くいます。感染者のほとんどは症状が軽いか無症状なので、検査を受けるかどうかにかかわらず、風邪薬を飲まなければならないと言う人もいるかもしれません。それで、ウイルス検査をする意味はあるのでしょうか?

「開放は横になることを意味する」「新型コロナウイルスの存在を気にする必要はない」と考える人もいる。しかし、それは絶対にそうではありません。中国より先に多数の防疫措置を解除した国や地域は、現在も新型コロナウイルスの検査と流行監視を継続している。我が国も、流行の方向性を理解し、的を絞った対策を策定する際に受動的にならないよう、彼らの成功事例から学ぶことができます。

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ウイルスと共存することは、その存在を無視することを意味しない

現在流行しているオミクロンウイルス株の毒性は以前のウイルス株よりも弱く、国内の大多数の人々がワクチン接種を受けているものの、感染後も軽い症状しか出ないか、まったく症状が出ない人も多いため、過度に恐れる必要はないが、オミクロンが高リスクグループに及ぼす脅威を過小評価することはできない。香港のデータによると、80歳以上の未接種者におけるオミクロン感染による死亡率は依然として14.6%と高く、不活化ワクチンを3回接種した後の死亡率は依然として2%であった[1]。

高リスクグループを保護する観点から、新型コロナウイルス感染症の状況を適切に監視し、予防・抑制計画を的確に調整する必要があります。また、オミクロンの感染力は非常に強く、オミクロンの第1波では2～3か月以内に米国、シンガポール、香港、台湾などの人口の20～30％が感染した。短期間に多数の感染者が出ている状況は、社会の正常な運営にも影響を及ぼすことになるでしょう。現在、国内の多くの医療従事者が陽性反応を示しているが、依然として出勤を主張している。また、感染状況を適宜監視することにより、医療資源の配分や社会サービス等の面でも必要な準備を行っていくことが可能になります。

さらに、流行の進行はウイルスも絶えず複製していることを意味し、ウイルスの複製ごとに変異のリスクが発生します。昨今、二次感染のリスクを心配する人が増えています。一般的に、3 か月以内の二次感染のリスクは非常に低いです。しかし、免疫逃避を強化した新たな変異株が出現すると、二次感染のリスクが大幅に高まります。新型コロナウイルスの検査がなければ、ウイルスの変異を発見することは当然不可能であり、ましてや潜在的な新たな変異株を警告し、予防することは不可能である。

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核酸検査の量が減った。流行の動向をどう判断するか？

同国は過去数年間、大規模な核酸検査を実施し、ほぼすべての感染例を発見し、さらに大多数の濃厚接触者を特定して隔離・管理し、感染拡大を阻止してきた。しかし、このレベルの予防と制御には、人的資源と物的資源の面で非常に高いコストがかかり、感染者数が増加するにつれて、ますます持続不可能になるでしょう。感染症が流行した今、核酸検査ですべての感染例を見つけることは不可能です。しかし、これは核酸検査が役に立たないということを意味するものではありません。特定の検査を通じて、依然として流行の傾向に関する重要な情報を提供することができます。

核酸検査では 2 つの情報が得られます。1 つは陽性症例の数です。これにより、これまで私たちが唯一注目していた感染状況に関する情報が直接提供されます。しかし、一定量の核酸検査を集計すると、「陽性検出率」、つまり検査を受けた人のうち陽性であった人の数という別のデータが得られます。同じ数の核酸検査だけを実施すると、市中感染が深刻になるほど検査量が不足し、陽性検出率が高くなります。

陽性症例数と陽性検出率を組み合わせることで、流行の傾向に関する特定の情報を得ることができます。核酸検査の不足は多くの国が長年直面している問題であり、陽性検出率を加えて市中感染を判断する国際的な経験もあります。例えば、米国CDCが導入したコミュニティ感染状況評価基準では、新規症例数と陽性検出率を組み合わせています[2]。

米国CDCのコミュニティ感染基準

1週間あたり10万人あたりの新規感染者数と核酸陽性検出率を合わせたものです。どちらの指標がより高い感染リスクに対応するかが、感染リスクのレベルを示します。日常的な核酸検査は廃止されましたが、病院などの特別な場所では核酸検査がまだ行われています。これらの場所での検査は、ある程度、地域社会のサンプル抽出と見ることができます。陽性検出率を流行分析に組み込むことで、より正確な流行傾向を把握することができます。

もちろん、抗原を使った自己検査に頼る人が増えるかもしれません。これらのデータは、最終的に研究室で完了する核酸検査よりも収集が困難です。この点に関しては、香港とシンガポールが参考になります。両国とも住民に抗原検査の陽性結果を報告するためのオンライン窓口を提供しています[3-4]。こうした自己申告では実際の陽性者数を過小評価してしまうことは避けられないが、それでも流行の傾向を判断するのに役立つだろう。例えば、2022年以降のシンガポールの流行状況の変化を見てみましょう[5]：

シンガポールにおけるオミクロン流行の変化

抗原陽性症例の多くは報告されていない可能性があるため、具体的な症例数は過小評価される可能性が高いものの、全体的な傾向は少なくともいくつかの異なるオミクロン亜株の影響を反映しています。こうしたデータは、公衆衛生部門がよりよい伝染病予防の勧告を行うのに役立つほか、一般の人々が伝染病の現状を理解し、個人の健康を管理することも可能になります。

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COVID-19の影響の監視は「舞台裏」で行うことができる

核酸検査と抗原検査は、COVID-19を検出するための従来の方法であり、データは検査を受ける各個人に固有のものとなります。可能な限り広範囲に検査へのアクセスを提供し、可能な限り多くの検査結果を収集したとしても、検査を受けていない人や抗原検査の結果をアップロードしていない人がいる状況に遭遇するでしょう。新型コロナウイルスとの共存期間が長くなるにつれ、検査を受ける意欲も低下する可能性がある。したがって、これらの従来の検出方法に加えて、流行監視の完全性を確保するために、いくつかの「舞台裏」の行動も考慮する必要があります。

参考にすべきアプローチの一つは、家庭下水中の新型コロナウイルスを監視することだ。たとえば、米国では国家廃水監視システム (NWSS) が確立されています。 NWSS にはすべての地域が参加できます。現在、米国全土で廃水中のCOVID-19の量を監視するためのサンプリングポイントが1,304か所あります[6]。

NWSSの原理は、COVID-19に感染した人々の家庭排水には一定量のCOVID-19が含まれている（必ずしも伝染性ではなく、単に死んだウイルスである可能性もある）というものです。地域の家庭排水が対応する下水処理場で収集されると、サンプルが採取され、サンプルのウイルスゲノム検査が行われ、COVID-19が存在するかどうか、それがどの株であるか、そしてどれだけのウイルスが存在するかが判定されます[7]。これはコミュニティ全体の流行状況を監視することと同じです。

現在のNWSS検査結果[6]を参照すると、多くの監視ステーションで地元の新型コロナウイルス感染症の症例数が増加していることが示されていることがわかります。これは、個人検査が減った場合、COVID-19の流行が鈍化しているのではなく、検査が不十分であると公衆衛生局に伝えるのと同じことだ。

NWSS COVID-19 監視結果

流行がある程度まで進むと、感染者数そのものよりも、医療システムが新型コロナウイルスによってどの程度影響を受けているかということにもっと注目が集まるかもしれない。この点に関しては、現在の米国CDCのCOVID-19コミュニティリスク指数[8]を参照することができます。

CDC COVID-19コミュニティリスク指標

これらの指標は、新規感染者数が増加したときに病院に何人の新規COVID-19入院患者がいるか、またベッドの何パーセントがCOVID-19患者で占められているかを示します。これらのデータを組み合わせることで、流行による疾病負担が社会に与える影響をより正確に反映できるほか、特定の地域の医療システムにかかる圧力も反映できます。

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COVID-19の変異を監視することは重要

新型コロナウイルスと共存した後、新型コロナウイルスを検出するには、流行の動向や医療体制への圧迫を把握するだけでなく、新型コロナウイルス自体の変化、つまり変異株の進化を監視する必要がある。

COVID-19パンデミックの発生から3年が経ち、流行の方向性に大きな変化が起こり、新たな変異株も出現した。 2020年末、アルファ変異体の出現により、新型コロナウイルスの世界的な感染拡大が加速しました。 2021年夏、デルタの出現により流行の新たなピークが到来しました。そして2021年末、オミクロンの出現により流行の方向が変わりました。 2022年はオミクロンの流行によって一年中引き起こされましたが、オミクロン内のさまざまな亜株の変化によって、さまざまな地域で繰り返し流行が発生しました。

たとえば、私たちが以前見たシンガポールでの流行の変化では、BA.1 から BA.5、そして XBB へと変化しましたが、3 つのピークは 3 つのオミクロン亜株に対応しています。これら 3 つの亜株の免疫逃避能力は絶えず増加しています。 BA.5 は BA.1 から免疫回避することができ、XBB は BA.5 からある程度回避することができます。この免疫回避の違いにより、以前のオミクロン亜株の流行が終息した後、次のオミクロン亜株が出現することになります。

流行中の新型コロナウイルス変異株の進化を理解することは、流行の動向を予測する上で極めて重要であると言えます。オミクロン亜株の急速な変化により、ウイルスゲノムのタイムリーな監視がさらに重要になります。例えば、米国では、主流のオミクロン亜種は今年ほぼ3〜4か月ごとに変化しており、これはアルファデルタが半年にわたって主流を支配していた前回の時期よりも大幅に速い[9]。

図: 米国における主流コロナウイルス株の進化

したがって、新型コロナウイルスの検出を基礎として、検査サンプルを採取し、各地の現在の流行状況を表すのに十分なサンプルサイズを選択して、ウイルスの全ゲノム配列を解析し、ウイルス株を特定する必要があります。

国内での流行が拡大するにつれ、ウイルスゲノムの追跡がますます重要になるだろう。ワクチンや治療薬の有効性の確認も含まれるからです。海外でますます人気が高まっているBQ.1およびXBBウイルス株は、市場に出回っているすべてのモノクローナル抗体薬を無効にしており、これは現在流行しているウイルス株を理解することが治療薬の選択に直接関係していることを完全に実証しています。

12月20日に行われた国務院共同予防・抑制メカニズムの記者会見で、CDCの専門家らは中国が国家規模の新型コロナウイルスゲノムデータベースを構築中であると述べた。 「中国国民の新型コロナウイルス変異株監視業務計画」によると、各省は3つの都市を選び、各都市は1つのセンチネル病院を選び、各センチネル病院は毎週15人の外来患者と救急患者、10人の重症患者、全死亡者からサンプルを採取し、ゲノム配列を解析する必要がある。国家規模の新型コロナウイルスゲノムデータベースを確立するためには、配列データを1週間以内にアップロードする必要がある[10]。

これは非常に重要なステップだが、検査の量から判断すると、国内の実際のウイルス株を代表するものとは程遠いものと思われる。まず、このサンプリング方法は大都市の中央病院に集中しており、町や農村地域はおろか、中小都市を代表することはできません。第二に、死亡例を除くと、各病院で毎週検査される症例はわずか25件、州全体ではわずか75件です。全国的な流行を考慮すると、これは非常に少ない量です。昨今、インターネット上ではさまざまな変異株に関する噂が絶えず流れています。例えば、北部のウイルス株は南部よりも深刻であり、一部の感染はデルタによって引き起こされたという推測さえあります。ウイルスゲノムの包括的な監視があれば、パニックを引き起こす可能性のあるこれらの噂も回避できます。

2021年初頭に米国が設定した基準は、確認された症例の5％を配列決定することである[11]。カリフォルニア州では、COVID-19症例の15％と13％がそれぞれ2022年9月と10月に配列決定された[12]。感染例が大量に報告されないことを考慮すると、より多くの核酸検査サンプルの全ゲノム配列を解析することによってのみ、現在のウイルス株の実際の流行状況を表すのに十分なデータを得ることができます。

我々が必要とする新型コロナウイルスのゲノムモニタリングは、現在国内で流行しているさまざまなウイルス株の割合を反映できるだけでなく、一定の予測機能も持つはずだ。米国CDC[13]がまとめた米国における新型コロナウイルス株の推移を参照すると、現在米国ではBQ.1とBQ.1.1が最大の割合を占めているが、XBBも増加しており、今後さらにその割合が増加する可能性がある。かつて主流を占めていた BA.1 はすでに少数派になっており、今後も減少し続けるでしょう。同時に、BA.4.6 と BF.7 は、BQ.1 および BQ.1.1 との競争で優位に立つことができませんでした。この情報は、流行の今後の傾向を判断し、どの薬の有効性が影響を受けるかを判断するのに役立ちます。

米国のコロナウイルス株の変化

新型コロナウイルスとの共存は私たち自身の選択ではなく、避けられない現実です。しかし共存は、新型コロナウイルスがもはや私たちの健康に脅威を与えるウイルスではなくなったことを意味するものではありません。結局、オミクロンの病原性は低下しただけで、プロバイオティクスにはなっていません。そのため、流行の動向を把握し、それに応じた予防・抑制計画を策定し、人々が自ら予防判断を下せるようにするなど、さまざまな観点から、新型コロナウイルスの監視を継続し、関連データの発表をより正確にする必要がある。さらに、新型コロナウイルスの変異速度が極めて速いことを考慮すると、この種の監視には、ウイルス株の変化をタイムリーに検出できるような一定の「深さ」も必要となる。

つまり、COVID-19との共存は、それを無視するのではなく理解することに基づいており、COVID-19の継続的かつ効果的な監視がこの理解の基礎となります。

参考文献

[1] https://www.covidvaccine.gov.hk/pdf/death_analysis.pdf

[2] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/indicators-monitoring-community-levels.html

[3] https://www.chp.gov.hk/ratp/#

[4] https://www.sync.gov.sg/

[5] https://www.moh.gov.sg/covid-19/statistics

[6] https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#wastewater-surveillance

[7] https://www.cdc.gov/healthywater/surveillance/wastewater-surveillance/wastewater-surveillance.html#how-wastewater-surveillance-works

[8] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/indicators-monitoring-community-levels.html

[9] https://www.cdc.gov/vaccines/acip/meetings/downloads/slides-2022-09-01/07-COVID-Swanson-508.pdf

[10] http://wsjkw.hebei.gov.cn/html/zwyw/20221221/392832.html

[11] https://www.science.org/content/article/us-rushes-fill-void-viral-sequencing-worrisome-coronavirus-variants-spread

[12] https://www.cdph.ca.gov/Programs/CID/DCDC/Pages/COVID-19/COVID-Variants.aspx

[13] https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions

制作：中国科学普及協会

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